La diferenciación entre ciencias naturales y sociales es útil para entender que los objetos de estudio no son los mismos en las ciencias experimentales que en las Humanidades.
En este sentido, los métodos de investigación siguen dos tradiciones distintas.  La empírico-analítica es la característica de las ciencias duras y naturales y la hermenéutica es la propia de las ciencias sociales o humanas.  Es indudable que frente a dualismos excluyentes se pueden buscar métodos mixtos y flexibles.
La matemática es una ciencia formal y deductiva al igual que la lógica. El enfoque metodológico propio de las ciencias experimentales es  la explicación. En cambio, la comprensión es el método propio de la historia y de otras disciplinas humanísticas.
Si bien las explicaciones son conocimiento de la realidad y de las causas, también es cierto que la comprensión de los sentidos de los acontecimientos requiere un proceso de investigación participante que es también observacional y empírico en toda regla. Es verdad, como dicen muchos pensadores y científicos, que en muchas ocasiones no  es fácil separar la explicación de la comprensión, porque están interconectadas.